Un gran impulso en la búsqueda de medicamentos y vacunas puede venir de la respuesta a algunas preguntas simples sobre los orígenes del coronavirus que aún están en juego. ¿En qué especie animal se manifestó por primera vez el coronavirus? COVID-19? ¿Un murciélago, un pangolín u otra especie salvaje? ¿De dónde viene? ¿De una cueva (o bosque) en la provincia china de Hubei o en otro lugar?
En diciembre de 2019, 27 de las primeras 41 personas ingresadas en el hospital (66%) pasaron por un mercado ubicado en el corazón de la ciudad de Wuhan, provincia de Hubei. Pero, según uno estudio realizado en el hospital de Wuhan y publicado en Lancet El primer caso humano identificado no asistió a este mercado.
Una estimación de la datación molecular basada en secuencias genómicas de SARS-CoV-2 su origen se remonta a noviembre. Y eso plantea preguntas sobre los orígenes del coronavirus, particularmente el vínculo entre esta epidemia de COVID-19 y la vida silvestre.
Datos genómicos
Il El genoma del SARS-CoV-2 es fue secuenciado "rápidamente" por investigadores chinos. Análisis genómico Los comparativos mostraron que el SARS-CoV-2 pertenece al grupo de betacoronavirus y eso está muy cerca de Sars-cov, responsable de una epidemia de neumonía aguda que apareció en noviembre de 2002 en la provincia china de Guangdong y luego se extendió a 29 países en 2003. El SARS registró 8.098 casos, incluidas 774 muertes. Se sabe que tales murciélagos son Rhinolophus fueron los reservorio de este virus y que un pequeño carnívoro, la civeta de las palmas (larva paguma), puede haberlo hecho desde invitado intermedio entre murciélagos y los primeros casos humanos.
Desde entonces, muchos betacoronavirus han sido descubiertos, principalmente en murciélagos, pero también en humanos. Por ejemplo, RaTG13, aislado de un murciélago de la especie. Rhinolophus affinis recolectado en la provincia china de Yunan, recientemente se ha descrito como muy similar al SARS-CoV-2, con 96% de secuencias genómicas idénticas .
Estos resultados indican que los murciélagos, y especialmente las especies del género Rhinolophus, constituyen el reservorio de los virus SARS-CoV y SARS-CoV-2.
¿Pero cómo se define un tanque? Un reservorio es una o más especies animales que son poco o nada susceptibles al virus, pero lo albergan. La ausencia de síntomas de la enfermedad se explica por la efectividad del sistema inmunológico de estos animales, que les permite combatir la proliferación viral.
Mecanismo de recombinación
FEBRERO 7 2020 Más tarde, la ciencia se enteró de que se había descubierto un virus aún más cercano al SARS-CoV-2 en el pangolín. Con el 99% del concordancia genómica, el pangolín se consideraba un tanque más probable que los murciélagos.
Todos se asentaron en los orígenes del coronavirus, entonces? Aún no.
Posteriormente, uno estudio más reciente y aún bajo investigación muestra que el genoma del coronavirus aislado del pangolín de Malasia (joven javanica) es menos como SARS-Cov-2, con solo el 90% de concordancia genómica. Esto indicaría que el virus aislado en el pangolín no es responsable de la epidemia de COVID-19 que se está propagando actualmente.
Proteína S
Sin embargo, el coronavirus aislado del pangolín es 99% similar en 74 aminoácidos involucrados en el dominio de unión del receptor de angiotensina II, lo que permite que el virus ingrese a las células humanas para infectarlas. En contraste, el virus RaTG13 aislado del murciélago Rhinolophus affinis es muy divergente en esta parte específica (solo un 77% de similitud). En la práctica, el coronavirus aislado del pangolín puede ingresar a las células humanas, mientras que el aislado del murciélago Rhinolophus affinis No lo es.
Además, estas comparaciones genómicas sugieren que el virus SARS-Cov-2 es el resultado de una recombinación entre dos virus diferentes, uno cercano al RaTG13 y el otro más cercano al virus del pangolín. En otras palabras, sería una quimera entre dos virus preexistentes.
Este mecanismo de recombinación fue ya se ha descrito en coronavirus, en particular para explicar el origen del SARS-CoV. Es importante saber que la recombinación da como resultado un nuevo virus potencialmente capaz de infectar una nueva especie huésped.
Para que ocurra la recombinación, los dos virus divergentes deben haber infectado el mismo organismo simultáneamente.
Dos preguntas quedan ahora sin respuesta: ¿en qué organismo se produjo esta recombinación? (¿un murciélago, un pangolín u otra especie?) Y sobre todo, ¿en qué condiciones se produjo esta recombinación?